Vocabulaire de la génétique

amplification en chaîne par polymérase

Abréviation : ACP.

Domaine : Génétique-Biochimie et biologie moléculaire.

Définition : Procédé d’amplification exponentielle in vitro d’une séquence définie d’ADN, faisant intervenir des cycles successifs d’appariements d’oligonucléotides spécifiques et d’élongation à l’aide d’une polymérase.

Note :

1. On trouve aussi, dans le langage professionnel, le terme « méthode PCR » ou, plus simplement, « PCR ».

2. La méthode peut être appliquée à de l’ADN cloné, de l’ADN génomique purifié, ou à de l’ADN présent dans une seule cellule, une tache de sang, un follicule de cheveu ou un fossile.

Équivalent étranger : PCR method, polymerase chain reaction (PCR).

Attention : Cette publication annule et remplace celle du Journal officiel du 22 septembre 2000.



analyse en série de l’expression des gènes

Domaine : Génétique-Biochimie et biologie moléculaire.

Définition : Méthode permettant d’établir un profil d’expression génique par l’analyse quantitative de milliers de transcrits d’une cellule ou d’un tissu.

Note :

1. On trouve aussi, dans le langage professionnel, le terme « méthode SAGE ».

2. La méthode est fondée sur l’isolement, par endonucléase de restriction, de courts fragments d’ADN complémentaire issus d’une population d’ARN messagers qui sont réassemblés, sous forme d’étiquettes en série, en une longue molécule d’acide nucléique, amplifiée et séquencée.

3. Une courte séquence (étiquette de 10 à 14 nucléotides) suffit à caractériser chacun des ARN messagers ; le nombre d’occurrences d’une même étiquette permet de déterminer le niveau d’expression du transcrit correspondant.

Équivalent étranger : SAGE method, serial analysis of gene expres​sion(SAGE).



étiquette de séquence transcrite

Abréviation : EST.

Domaine : Génétique-Biochimie et biologie moléculaire.

Définition : Courte séquence de 300 à 500 nucléotides, résultant du séquençage partiel de chacun des clones de banques d’ADN complémentaire obtenus après extraction des ARN messagers d’un matériel vivant.

Note : Les étiquettes de séquences transcrites (EST) fournissent une image instantanée des gènes exprimés dans un matériel. Ces séquences partielles sont comparées une à une à celles stockées dans les bases de données (en anglais : dbEST) et peuvent être utilisées pour la cartographie de l’ADN génomique.

Équivalent étranger : expressed sequence tag (EST).



exposition sur phage

Domaine : Génétique-Biochimie et biologie moléculaire.

Définition : Incrustation, à la surface de l’enveloppe protéique d’un phage filamenteux, de peptides, de fragments d’anticorps ou d’autres protéines, provoquée par l’introduction de séquences correspondantes d’oligonucléotides dans le génome de ce phage.

Note : Cette technique permet de caractériser de nouveaux épitopes d’antigènes, de sélectionner des anticorps monoclonaux, d’identifier des substrats d’enzymes, des ligands naturels, des récepteurs, des sites d’interaction entre protéines ou entre protéines et acides nucléiques. Elle est utilisée pour découvrir de nouvelles molécules thérapeutiques.

Équivalent étranger : phage display.



génome, n.m.

Domaine : Génétique-Biochimie et biologie moléculaire.

Définition : Ensemble du matériel héréditaire composé d’acides nucléiques (ADN ou ARN) d’un organite cellulaire, d’un organisme ou d’une espèce.

Note :

1. Le génome des procaryotes et des eucaryotes est composé d’ADN, celui des virus est formé soit d’ADN, soit d’ARN. Chez les eucaryotes, l’ADN est contenu dans les chromosomes du noyau et dans les organites cellulaires (mitochondries et plastes) ; chez les procaryotes, dans le chromosome et dans les plasmides.

2. Chez les eucaryotes, on définit le génome nucléaire de l’espèce par le lot haploïde de chromosomes que portent les gamètes.

Équivalent étranger : genome.



génomique, n.f.

Domaine : Génétique-Biochimie et biologie moléculaire.

Définition : Branche de la génétique qui étudie les génomes.

Note :

1. Les méthodes d’étude de la génomique appellent une approche pluridisciplinaire.

2. Le terme « génomique » s’emploie aussi adjectivement.

Voir aussi : génomique fonctionnelle, génomique structurale.

Équivalent étranger : genomics.



génomique fonctionnelle

Domaine : Génétique-Biochimie et biologie moléculaire.

Définition : Partie de la génomique qui étudie la fonction des gènes, leur régulation et les interactions de leurs produits d’expression, ARN et protéines.

Note : L’étude nécessite l’analyse simultanée du transcriptome et du protéome, dans diverses conditions physiologiques et sur divers génotypes sauvages et mutants ainsi que l’intégration des données obtenues.

Voir aussi : génomique, protéome, transcriptome.

Équivalent étranger : functional genomics.



génomique structurale

Domaine : Génétique-Biochimie et biologie moléculaire.

Définition : Partie de la génomique qui étudie la structure physique et l’organisation du génome et du protéome.

Note : Dans une acception restreinte, la génomique structurale désigne la détermination de la structure tridimensionnelle des protéines et la compréhension des propriétés physicochimiques et biologiques qui en résultent.

Voir aussi : génomique, protéome.

Équivalent étranger : structural genomics.



hybridation soustractive sélective

Abréviation : HSS.

Domaine : Génétique-Biochimie et biologie moléculaire.

Définition : Technique de criblage différentiel utilisée pour comparer deux matériels donnés en déterminant les ARN messagers propres à chacun d’eux, par élimination de ceux qu’ils ont en commun.

Équivalent étranger : suppression subtractive hybridization (SSH).



protéome, n.m.

Domaine : Génétique-Biochimie et biologie moléculaire.

Définition : Ensemble des protéines codées par un génome, à un moment déterminé, et caractérisées par leur quantité et leur conformation.

Équivalent étranger : proteome.



protéomique, n.f.

Domaine : Génétique-Biochimie et biologie moléculaire.

Définition : Discipline qui identifie et caractérise les protéines d’une cellule ou de l’un de ses compartiments, et analyse leur expression, leur fonction et leurs interactions.

Équivalent étranger : proteomics.



technique de Western

Domaine : Génétique-Biochimie et biologie moléculaire.

Voir : transfert de protéines.



transcriptome, n.m.

Domaine : Génétique-Biochimie et biologie moléculaire.

Définition : Ensemble des ARN messagers traduisant l’expression génique totale d’une cellule, d’un tissu ou d’un organisme à un moment donné.

Équivalent étranger : transcriptome.



transfert de protéines

Domaine : Génétique-Biochimie et biologie moléculaire.

Synonyme : technique de Western.

Définition : Technique consistant à transférer des protéines d’un gel de polyacrylamide vers une membrane support, sur laquelle les molécules recherchées sont repérées à l’aide d’anticorps spécifiques marqués.

Note : Le terme « technique de Western » repose sur un jeu de mots analogique avec le terme « technique de Southern », formé à partir du nom de l’inventeur de cette technique.

Voir aussi : transfert d’ADN, transfert d’ARN.

Équivalent étranger : Western blot analysis, Western blotting.

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